MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC plasmid pALIDE01

Total Repeats: 1917

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014908	GAA	2	6	33225	33230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760054
502	NC_014908	ACAA	2	8	33411	33418	75 %	0 %	0 %	25 %	319760054
503	NC_014908	GCG	2	6	33472	33477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760054
504	NC_014908	TGA	2	6	33503	33508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760054
505	NC_014908	CAAA	2	8	33522	33529	75 %	0 %	0 %	25 %	319760054
506	NC_014908	AGA	2	6	33606	33611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760054
507	NC_014908	ATC	2	6	33612	33617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760054
508	NC_014908	TTCTT	2	10	33662	33671	0 %	80 %	0 %	20 %	319760054
509	NC_014908	GCT	2	6	33712	33717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760054
510	NC_014908	TGGT	2	8	33807	33814	0 %	50 %	50 %	0 %	319760054
511	NC_014908	CCA	2	6	33905	33910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760054
512	NC_014908	TGC	2	6	33912	33917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760054
513	NC_014908	ATG	2	6	33946	33951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760054
514	NC_014908	TGG	2	6	34086	34091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760054
515	NC_014908	AATCA	2	10	34108	34117	60 %	20 %	0 %	20 %	319760054
516	NC_014908	GCA	2	6	34143	34148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760054
517	NC_014908	GTA	2	6	34216	34221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760054
518	NC_014908	CAAC	2	8	34228	34235	50 %	0 %	0 %	50 %	319760054
519	NC_014908	CTG	2	6	34259	34264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760054
520	NC_014908	GCT	2	6	34270	34275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760054
521	NC_014908	GTC	2	6	34302	34307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760054
522	NC_014908	GGC	2	6	34407	34412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760054
523	NC_014908	ATT	2	6	34469	34474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319760054
524	NC_014908	GGAT	2	8	34482	34489	25 %	25 %	50 %	0 %	319760054
525	NC_014908	AGTC	2	8	34495	34502	25 %	25 %	25 %	25 %	319760054
526	NC_014908	TGG	2	6	34515	34520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760054
527	NC_014908	TGGAGG	2	12	34551	34562	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	319760054
528	NC_014908	GCG	2	6	34591	34596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760054
529	NC_014908	TAA	2	6	34602	34607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319760054
530	NC_014908	AAG	2	6	34649	34654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760054
531	NC_014908	GGA	2	6	34691	34696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760054
532	NC_014908	GGA	2	6	34726	34731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760054
533	NC_014908	GGC	2	6	34978	34983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760054
534	NC_014908	CAAA	2	8	35013	35020	75 %	0 %	0 %	25 %	319760054
535	NC_014908	CCA	2	6	35054	35059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319760054
536	NC_014908	GAA	2	6	35118	35123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319760054
537	NC_014908	GCT	2	6	35176	35181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760054
538	NC_014908	ATG	2	6	35195	35200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760054
539	NC_014908	CTG	2	6	35294	35299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760054
540	NC_014908	GCG	2	6	35317	35322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760054
541	NC_014908	GCT	2	6	35323	35328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760054
542	NC_014908	GCA	2	6	35398	35403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760054
543	NC_014908	GGA	2	6	35425	35430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760054
544	NC_014908	GC	3	6	35505	35510	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
545	NC_014908	GAT	2	6	35526	35531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319760054
546	NC_014908	GGCAG	2	10	35538	35547	20 %	0 %	60 %	20 %	319760054
547	NC_014908	CAAT	2	8	35551	35558	50 %	25 %	0 %	25 %	319760054
548	NC_014908	TCA	2	6	35584	35589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319760054
549	NC_014908	TGC	2	6	35685	35690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760054
550	NC_014908	GAAA	2	8	35724	35731	75 %	0 %	25 %	0 %	319760054
551	NC_014908	AGC	2	6	35760	35765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760054
552	NC_014908	CATC	2	8	35923	35930	25 %	25 %	0 %	50 %	319760054
553	NC_014908	GCAG	2	8	35964	35971	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
554	NC_014908	TGC	2	6	35979	35984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319760054
555	NC_014908	AGG	2	6	35988	35993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319760054
556	NC_014908	GCA	2	6	35995	36000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760054
557	NC_014908	CGGC	2	8	36029	36036	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
558	NC_014908	AGC	2	6	36080	36085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760054
559	NC_014908	GGC	2	6	36091	36096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760054
560	NC_014908	GTAGCG	3	18	36101	36118	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	319760054
561	NC_014908	GGT	2	6	36121	36126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760054
562	NC_014908	GGT	2	6	36130	36135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760054
563	NC_014908	GTG	4	12	36140	36151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319760054
564	NC_014908	GCA	2	6	36240	36245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760054
565	NC_014908	GCC	2	6	36250	36255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760054
566	NC_014908	GCG	2	6	36271	36276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760054
567	NC_014908	CGC	2	6	36279	36284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760054
568	NC_014908	GC	3	6	36359	36364	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
569	NC_014908	CGC	2	6	36377	36382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760054
570	NC_014908	GCA	2	6	36406	36411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760054
571	NC_014908	GCC	2	6	36418	36423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760054
572	NC_014908	GC	3	6	36428	36433	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
573	NC_014908	CGG	2	6	36458	36463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760054
574	NC_014908	GCACCG	2	12	36475	36486	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319760054
575	NC_014908	GCC	2	6	36487	36492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760054
576	NC_014908	GC	3	6	36497	36502	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
577	NC_014908	CGAG	2	8	36503	36510	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
578	NC_014908	CAG	2	6	36524	36529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760054
579	NC_014908	CCGA	2	8	36571	36578	25 %	0 %	25 %	50 %	319760054
580	NC_014908	GCG	2	6	36595	36600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760054
581	NC_014908	AGCGC	2	10	36634	36643	20 %	0 %	40 %	40 %	319760054
582	NC_014908	CGG	2	6	36665	36670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760054
583	NC_014908	AGCGC	2	10	36703	36712	20 %	0 %	40 %	40 %	319760054
584	NC_014908	GCA	2	6	36718	36723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760054
585	NC_014908	GCG	2	6	36733	36738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760054
586	NC_014908	GGC	2	6	36765	36770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760054
587	NC_014908	CGAG	2	8	36779	36786	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
588	NC_014908	GCG	2	6	36802	36807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760054
589	NC_014908	GC	3	6	36842	36847	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
590	NC_014908	CGG	2	6	36872	36877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760054
591	NC_014908	GCACCG	2	12	36889	36900	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319760054
592	NC_014908	GCC	2	6	36901	36906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760054
593	NC_014908	GC	3	6	36911	36916	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
594	NC_014908	CGAG	2	8	36917	36924	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
595	NC_014908	CAG	2	6	36938	36943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760054
596	NC_014908	GGC	2	6	36972	36977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760054
597	NC_014908	GC	3	6	36980	36985	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
598	NC_014908	CGG	2	6	37010	37015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760054
599	NC_014908	GCACCG	2	12	37027	37038	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319760054
600	NC_014908	GCC	2	6	37039	37044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760054
601	NC_014908	GC	3	6	37049	37054	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
602	NC_014908	CGAG	2	8	37055	37062	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
603	NC_014908	CAG	2	6	37076	37081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760054
604	NC_014908	CCGA	2	8	37123	37130	25 %	0 %	25 %	50 %	319760054
605	NC_014908	GGC	2	6	37179	37184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760054
606	NC_014908	CGAG	2	8	37193	37200	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
607	NC_014908	GCG	2	6	37216	37221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760054
608	NC_014908	GC	3	6	37256	37261	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
609	NC_014908	CGG	2	6	37286	37291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760054
610	NC_014908	GCACCG	2	12	37303	37314	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319760054
611	NC_014908	GCC	2	6	37315	37320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760054
612	NC_014908	GC	3	6	37325	37330	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
613	NC_014908	CGAG	2	8	37331	37338	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
614	NC_014908	GGC	2	6	37386	37391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760054
615	NC_014908	CGAG	2	8	37400	37407	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
616	NC_014908	GCG	2	6	37423	37428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760054
617	NC_014908	GC	3	6	37463	37468	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
618	NC_014908	CGAG	2	8	37538	37545	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
619	NC_014908	GC	3	6	37601	37606	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
620	NC_014908	CGG	2	6	37631	37636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319760054
621	NC_014908	GCACCG	2	12	37648	37659	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319760054
622	NC_014908	GCC	2	6	37660	37665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319760054
623	NC_014908	GC	3	6	37670	37675	0 %	0 %	50 %	50 %	319760054
624	NC_014908	CGAG	2	8	37676	37683	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
625	NC_014908	CAG	2	6	37697	37702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319760054
626	NC_014908	CCGA	2	8	37744	37751	25 %	0 %	25 %	50 %	319760054
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628	NC_014908	CGAG	2	8	37814	37821	25 %	0 %	50 %	25 %	319760054
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999	NC_014908	CAGC	2	8	59150	59157	25 %	0 %	25 %	50 %	319760084
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